Ici le contraste entre une nature ordonnancée et une nature d'aspect plus libre est fort. 130 espèces d'oiseaux (dont 49 espèces nicheuses) y sont régulièrement observées conférant au parc une valeur écologique reconnue. De ce fait, il a été déclaré zone naturelle d'intérêt écologique et faunistique (ZNIEFF). Les zones naturelles protégées du parc se situent sur le versant est de l'Octogone. Elles s'étendent sur une surface de 8 hectares, ce qui représente 16 % du boisement et 4,5 % de la surface du parc. Ce sont des terrains en pente, peu fréquentés par le public, caractérisés par un peuplement jeune qui n'a pas été endommagé par la tempête de décembre 1999. Deux mares y ont été créées pour permettre le développement des populations de crapauds accoucheurs et de tritons en forte régression jusqu'à présent. La création de ces zones de calme a favorisé pour la première fois en 2001 la nidification d'un couple d'éperviers, observé depuis plusieurs années.
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